Wycena nie musi być przeprowadzana przez nikogo poza inwestorami spółki oraz wartość tą powinien akceptować zarząd spółki, który odpowiada za realność jej aktywów. Pamiętajmy, że wartość aportu (jako kwota zgłoszona do Rejestru Sądowego) nie musi odpowiadać wartości przedmiotu aportu wycenionej przez Zarząd lub ekspertów (może być np.: mniejsza). Wartość oprogramowania będzie bowiem amortyzowana (podatkowo i niepodatkowo zależnie od relacji kapitału podstawowego i zapasowego utworzonego w wyniku przyjęcia aportu), co z kolei będzie miało wpływ na przyszłe zyski bilansowe i stopień zainteresowania urzędników skarbowych. Tak więc przyjęcie określonej kwoty jako aport to także decyzja polityczna a nie tylko ekonomiczna, wiążąca się czasami z poważnym ryzykiem.